Las funciones principales de las CME son: la preparación de la
elección municipal; la vigilancia del proceso electoral en su Ayuntamiento;
el cómputo y la declaración de validez de las elecciones en los municipios;
el otorgamiento de las constancias de mayoría y validez respectivas; así
como la asignación de regidores de representación proporcional.

Las Comisiones Municipales cuentan con  un equipo técnico administrativo
para realizar sus funciones. Además reciben el apoyo de los auxiliares
informativos, quienes son ciudadanos cuya principal responsabilidad es
proveer de información a la Comisión Municipal Electoral y a la Comisión
Estatal Electoral sobre el desarrollo de la jornada electoral.

En el proceso electoral de 2003, las Comisiones Municipales Electorales
estuvieron integradas por 204 Comisionados Municipales Electorales, de
un total de 557 solicitudes recibidas en la convocatoria pública expedida
por la Comisión Estatal Electoral.

Las Mesas Directivas de Casilla son organismos que se encargan de la recepción, escrutinio y cómputo de la votación el día de las elecciones. Estas se integran por un presidente, un secretario, dos escrutadores, y sus respectivos suplentes. Los funcionarios de casilla son designados bajo un proceso de doble sorteo o insaculación, con el fin de garantizar su imparcialidad. Durante el proceso electoral del 2003, se integraron 4,692 casillas.

Las Mesas Auxiliares de Cómputo tienen la función exclusiva de llevar a cabo el cómputo parcial de las elecciones de Diputados y Gobernador. Se integran con tres ciudadanos y un suplente común, designados por la Comisión Estatal Electoral mediante convocatoria pública. En el pasado proceso electoral, 252 ciudadanos integraron las Mesas Auxiliares de Cómputo, de un total de 1,142 solicitudes recibidas.